肛周癌的症状多为非特异性，常见便血，肛周瘙痒和不适感，症状常间断出现故不易引起病人的警觉。70%～80%的肛周癌初始曾被诊断为良性疾病，Bowen’s病常伴有持续的肛周瘙痒，Paget’s病病人可以无症状，也可表现为肛周瘙痒和出血性红斑。肛周癌常与Paget’s病、黏膜白斑、肛裂、肛瘘、痔等疾病相关。因此，常使肛周癌的诊断较为困难而发生误诊。由于这些原因导致不能及时早期诊断，就使得病情发展较快(60%～70%的病人肿块直径大于4cm)，进而逐渐出现排便疼痛以及排便习惯的改变，这提示病变损害往往已较明显。进展期可出现肛门失禁或直肠-阴道瘘的表现。

　　肛管癌多表现为肛管浸润性溃疡，溃疡边缘质地稍硬;在上段肛管，肿瘤有时可呈息肉样，但周边仍可见浸润性改变。

　　发生在下段肛管的肿瘤往往进展快，症状明显。肛门部可见明显的肿块，或者肿块位于阴道后部，也常累及肛门口、远端直肠和其他邻近组织器官(如阴道、前列腺等)，在15%～20%的病人中，肿瘤可累及骨盆直肠间隙，可表现为肛周脓肿或瘘。

　　肛周癌也可见腹股沟淋巴结肿大，有时为首发表现，此时病人可尚无任何症状。但是腹股沟淋巴结肿大常被误诊为炎性淋巴结肿大或者疝气而延误肛周癌的及时治疗。

　　个别病例在诊断出为肛周癌时已发生肝转移。